Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms