Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms