Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMB3Q13751 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms