Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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