Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
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