Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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