Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CALCOCO2Q13137 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CALCOCO2Q13137 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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