Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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