Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.751e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-202ENST00000462646 335 ntTSL 318.78■□□□□ 0.61e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.592e-16■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KLHL18-202ENST00000433449 560 ntTSL 418.43■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 LPIN2-203ENST00000584294 936 ntTSL 318.14■□□□□ 0.498e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-NBL1-202ENST00000602384 999 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KLHL18-203ENST00000437353 463 ntTSL 217.76■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-NBL1-203ENST00000602450 590 ntTSL 217.42■□□□□ 0.381e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RNF31-209ENST00000559071 1943 ntTSL 215.73■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-NBL1-201ENST00000602293 820 ntTSL 314.72□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-209ENST00000498642 669 ntTSL 214.63□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-203ENST00000467029 583 ntTSL 214.15□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-205ENST00000481464 657 ntTSL 313.76□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KLHL18-204ENST00000442272 2249 ntTSL 213.31□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-207ENST00000486890 677 ntTSL 312.11□□□□□ -0.471e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RNF31-224ENST00000560787 2834 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-7■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 PTBP2-205ENST00000460706 1129 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-7■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.658e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-210ENST00000617872 3678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KLHL18-205ENST00000461084 3206 ntTSL 210.51□□□□□ -0.731e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-201ENST00000322753 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MINOS1-206ENST00000485362 438 ntTSL 25.46□□□□□ -1.541e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KIF16B-204ENST00000450176 556 ntTSL 53.77□□□□□ -1.811e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.891e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.352e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-16■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.052e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 520.93■□□□□ 0.942e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.883e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-216ENST00000599488 514 ntTSL 419.75■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-211ENST00000524319 1648 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.712e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 UCHL5-203ENST00000367450 1355 ntTSL 519.29■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 FAF2-205ENST00000510730 684 ntTSL 319.25■□□□□ 0.672e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-210ENST00000571613 1688 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 218.45■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-208ENST00000521345 592 ntTSL 418.31■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-215ENST00000599137 608 ntTSL 418.15■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.89■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-207ENST00000595136 531 ntTSL 416.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 216.58■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-208ENST00000571043 1547 ntTSL 216.48■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-204ENST00000594893 1453 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-206ENST00000539417 1471 ntTSL 215.54■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.068e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.058e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-219ENST00000601147 583 ntTSL 215□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-211ENST00000596213 929 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-208ENST00000513781 759 ntTSL 314.52□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.098e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.118e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.138e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.198e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.218e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.218e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.218e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-213ENST00000573577 1282 ntTSL 213.38□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-205ENST00000595067 548 ntTSL 413.35□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-209ENST00000571558 1423 ntTSL 213.3□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-207ENST00000570883 953 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-216ENST00000575599 1359 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 LINC00969-214ENST00000446521 584 ntTSL 413.1□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.338e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 212.98□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.348e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKFY1-211ENST00000575298 665 ntTSL 512.82□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DOCK6-210ENST00000588666 444 ntTSL 512.46□□□□□ -0.414e-9■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-210ENST00000524072 580 ntTSL 512.45□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-218ENST00000600247 583 ntTSL 412.41□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 12.4
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 230.7 ms