Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms