Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms