Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms