Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms