Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms