Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms