Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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