Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms