Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORCP51449 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORCP51449 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms