Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLCSP50747 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLCSP50747 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLCSP50747 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLCSP50747 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLCSP50747 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLCSP50747 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLCSP50747 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms