Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRP9P49458 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms