Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms