Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4P46934 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4P46934 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms