Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCAMP43121 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCAMP43121 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCAMP43121 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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