Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC1A1P43005 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC1A1P43005 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms