Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKLRP30613 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PKLRP30613 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKLRP30613 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PKLRP30613 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PKLRP30613 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PKLRP30613 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms