Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms