Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRB3P28472 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms