Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTX3P26022 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTX3P26022 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms