Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms