Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DESP17661 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DESP17661 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DESP17661 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DESP17661 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DESP17661 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DESP17661 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DESP17661 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DESP17661 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DESP17661 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms