Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLUP10909 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLUP10909 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLUP10909 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLUP10909 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLUP10909 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLUP10909 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLUP10909 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLUP10909 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLUP10909 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms