Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI4P10075 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GLI4P10075 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GLI4P10075 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms