Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTA3P0C7M3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms