Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DYSFO75923 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DYSFO75923 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms