Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F6O75461 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F6O75461 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F6O75461 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms