Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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