Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAPO00193 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SMAPO00193 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SMAPO00193 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SMAPO00193 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SMAPO00193 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SMAPO00193 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SMAPO00193 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SMAPO00193 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAPO00193 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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