Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E9PBE3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E9PBE3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E9PBE3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E9PBE3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E9PBE3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E9PBE3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
E9PBE3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E9PBE3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
E9PBE3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E9PBE3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms