Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms