Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms