Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms