Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms