Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms