Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms