Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
V9GY05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
V9GY05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
V9GY05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
V9GY05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
V9GY05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
V9GY05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
V9GY05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
V9GY05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
V9GY05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
V9GY05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
V9GY05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
V9GY05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
V9GY05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
V9GY05 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
V9GY05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
V9GY05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
V9GY05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
V9GY05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
V9GY05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
V9GY05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
V9GY05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
V9GY05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
V9GY05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
V9GY05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
V9GY05 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
V9GY05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
V9GY05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
V9GY05 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
V9GY05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
V9GY05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
V9GY05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
V9GY05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
V9GY05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
V9GY05 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
V9GY05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
V9GY05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
V9GY05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
V9GY05 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
V9GY05 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
V9GY05 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
V9GY05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
V9GY05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
V9GY05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GY05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GY05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GY05 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
V9GY05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.33■■□□□ 1
V9GY05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
V9GY05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
V9GY05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GY05 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GY05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GY05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GY05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GY05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GY05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.3■■□□□ 1
V9GY05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GY05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GY05 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GY05 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GY05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GY05 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GY05 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GY05 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GY05 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GY05 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GY05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
V9GY05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
V9GY05 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms