Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN6Q9Y6Q1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN6Q9Y6Q1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms