Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms