Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX9Q9Y5X1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNX9Q9Y5X1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX9Q9Y5X1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX9Q9Y5X1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms