Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX13Q9Y5W8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX13Q9Y5W8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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