Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAI2Q9Y5P3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAI2Q9Y5P3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAI2Q9Y5P3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms